Les protéines :
sont des grosses molécules résultent de l'assemblage de plus de 100 acides
aminés par des liaisons peptidiques, Il existe des protéines d'origine animale
et des protéines d'origine végétale.
Les protéines présentent
différents niveaux structuraux au sein de l’organisme et jouent
plusieurs rôles biologiques tels que :
Le Mouvement coordonné: les
spermatozoïdes.
Le Transport et la mise en
réserve : l’hémoglobine.
Constituent des messages : les
neurotransmetteurs.
Catalyse des réactions chimiques
: les enzymes.
La Défense de l’organisme :
les anticorps.
La structure primaire des protéines est constituée
d’un enchaînement des acides aminés liés les uns aux autres par des liaisons
peptidiques dans un ordre précis.
La structure secondaire : c’est un repliement
local des acides aminés généralement en hélices alpha et en
feuillets beta dont la propriété principale est de stabiliser la structure de
la protéine par un caractère répétitif des liaisons hydrogènes
intramoléculaire.
Hélices alpha
Au sein d’une structure
d’hélice alpha qui présente bien dans les protéines fibreuses que
dans les protéines globulaires, la chaîne des acides aminés prend la forme
d'un tire-bouchon, Cette forme est le résultat de liaisons chimiques
intramoléculaires.
Caractéristiques de l’hélice alpha :
-Hydrophiles, amphipathique ou
encore hydrophobe selon la composition en acides aminés de
l'hélice.
-Constituée de 5 à plus de 40
acides aminés
-la structure est stabilisée
par les liaisons hydrogène de l'atome d'oxygène.
-Les radicaux des résidus sont
à l'extérieur de l'hélice.
-L’hélice ne peut s'établir
qu'avec des résidus de la même série (L ou D)
-Les plans des liaisons
peptidiques sont parallèles à l'axe de l'hélice et formant le squelette de
l'hélice.
-pas : 0,54 nm par tour.
NB :
Alanine, Glutamine, Leucine et Méthionine sont Les acides
aminés qui favorise la formation d'hélice α sont, par contre Les acides aminés
mauvais formateurs sont Proline, Glycine, Tyrosine et Serine.
Feuillets beta
Les feuillets beta se forment quand des parties de la longue chaîne polypeptidique se replient et se longent l'une l'autre, côte à côte, en formant des pont hydrogènes avec la voisine. On parle de feuillets beta parallèles quand les chaînes vont dans le même sens et d'antiparallèles quand elles vont dans des directions opposées. La direction des angles Φ et Ψ alterne dans un feuillet beta (un positif, l'autre négatif), donnant à la chaîne une allure en zigzag.
Caractéristiques de Feuillets beta
Les brins, au sein d'un
feuillet, peuvent être parallèles ou antiparallèles.
Le type antiparallèle de
feuillet est plus stable que le parallèle car les liaisons hydrogènes sont dans
un alignement parfait
La Glycine, Valine
et isoleucine sont présentent dans les feuillets β.
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Biochimie