La transcription chez les procaryotes ce fait au niveau du cytoplasme.
La synthèse de l'ARN comprend trois étapes: l'initiation, l'élongation, et la terminaison.
Initiation
Cette étape initiale est appelée "fixation sur le brin
matrice". Chez les bactéries, cette fixation est établie quand la sous
unité σ de l'ARN polymérase reconnaît le promoteur localisé dans la région 5'
du point de transcription initiale d'un gène.
Dans les promoteurs bactériens deux séquences ont été
détectées: TATAAT et TTGACA
Ces séquences sont appelées "éléments agissant en
cis". Contrairement aux "facteurs agissant en trans" qui sont
des molécules qui se fixent à ces éléments d'ADN. Une séquence consensus
comparable à celle de la région -10 a été identifiée dans la plupart des gènes
eucaryotes étudiés. Elle est appelée boite
TATA
il existe plusieurs formes alternatives de l'ARN polymérase,
chaque forme contient une sous-unité σ particulière. La sous-unité σ 70 est la
plus grande forme. Ces éléments trans reconnaissent les séquences consensus de
différents promoteurs et permettent une spécificité de l'initiation de la
transcription. Cela permet de contrôler leur expression. Une fois qu'elle a
reconnu le promoteur, et qu'elle s'y fixée, l'ARN polymérase catalyse
l'initiation.
Elongation
Une fois le duplexe temporaire est formé, la sous-unité σ se
dissocie de l'holoenzyme et l'élongation de la chaine se poursuit sous la
direction de la partie centrale de l'enzyme.. Par la suite la polymérase
parcourt le gène entier jusqu'à rencontrer une séquence dite de terminaison.
Terminaison
La terminaison commence dès l'enzyme rencontre un signal de
terminaison d'une séquence de 40 pb. Un aspect intéressent de la terminaison
chez les bactéries est que la séquence de terminaison ci-dessus est en fait
transcrite en ARN. Cette dernière forme une structure en tige boucle par
appariement de bases du même brin. L'ADN au niveau de la séquence de
terminaison est inversé au centre duquel une zone non répétée est insérée .
Dans tous les cas, les séquences impliquées dans la
terminaison sont localisées au niveau de l'ARN, cependant l'ARN étant transcrit
depuis l'ADN, la terminaison est au final toujours déterminée par des séquences
nucléotidiques spécifique sur l'ADN.
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Génétique